Pod Katedrą Wawelską znajduje się ciąg krypt. Pierwsza z nich, Zygmuntowska powstała w I połowie XVI wieku. Początkowo chowano tu władców Polski. Od XIX wieku Krypty stały się także miejscem pochówku najbardziej zasłużonych dla kraju dowódców, poetów, polityków i ludzi kultury.
Początkowo władców Polski chowano bezpośrednio pod posadzką Katedry Wawelskiej lub w jej wnętrzu. Pierwszą kryptę wybudowano po śmierci Jana Olbrachta. Pojedyncze pomieszczenie zostały z czasem nieco zapomniane. Dopiero w XIX wieku grupa architektów i artystów, w której znajdował się między innymi Jan Matejko przystąpiła do ich porządkowania. Połączono wtedy poszczególne sale korytarzami, co umożliwiło udostępnienie grobów królewskich dla ogółu społeczeństwa.
W XIX wieku zaczęto także chować w kryptach zasłużonych dowódców, polityków i ludzi kultury. Apogeum tego trendu miało miejsce po odzyskaniu niepodległości w dwudziestoleciu międzywojennym. Dzięki temu dziś Wawelskie Krypty to najważniejsza narodowa nekropolia. Spoczywają tu miedzy innymi Tadeusz Kościuszko, Adam Mickiewicz i Juliusz Słowacki. Ze wszystkich krypt wyróżnia się ta pod wezwaniem św. Leonarda. Jest to dawna romańska rotunda ukryta dziś pod posadzką gotyckiej katedry. W tym miejscu swoją mszę prymicyjną odprawiał Karol Wojtyła, późniejszy papież Jana Paweł II.