Muzeum Jana Pawła II mieści się w Pokamedulskim Klasztorze na Wigrach. W placówce zgromadzono pamiątki i przedmioty związane z papieżem. Jednym z ciekawszych eksponatów jest kajak składany typu "PAX" prod. NRD z roku 1957, na którym Karol Wojtyła pływał po rzekach Suwalszczyzny.
Miejsca na muzeum nie wybrano przypadkowo. W 1999 roku papież Jan Paweł II, w trakcie pielgrzymki do kraju, zatrzymał się w tym klasztorze na parę dni, żeby odpocząć.
Placówka składa się z Kaplicy Papieskiej, w której Ojciec Święty sprawował mszę świętą. Poza tym znajdują się tu Apartamenty Papieskie, w których papież się wypoczywał. Składają się one z pokoju dziennego i sypialni. Ich wygląd nie zmienił się od czasu wizyty gościa, dlatego zwiedzający mogą zobaczyć w jakich warunkach mieszkał. Dodatkowo znajduje się tu czytelnia i biblioteka, w której umieszczono dzieła i publikacje na temat Jana Pawła II.