Kościół św. Jana Ewangelisty w Szczecinie jest świątynią gotycką. Jest to ostatni zachowany budynek franciszkańskiego zespołu klasztornego. Najcenniejsze fragmenty kościoła to polichromie z XV i XVI wieku. Przedstawiają one Maryję w mandorli w otoczeniu świętych, chłopca z herbem Szczecina, zaślubiny św. Katarzyny oraz ornamenty roślinne.
Pierwszy franciszkański klasztor był drewniany. Kościół wzniesiony został z cegły. Budowano go etapami. Pierwsze powstało murowane prezbiterium ok. roku 1300. Korpus powstał prawdopodobnie w drugiej połowie XIV wieku. Natomiast w XV wieku wybudowano 10 kaplic między szkarpami.
W czasie reformacji zakonnicy musieli opuścić klasztor. Od tamtego czasu, aż do końca drugiej wojny światowej kościół był świątynią ewangelicką. W XVI wieku budynki klasztorne zmienione zostały na szpital św. Jana. Kościół nadal pełnił funkcje religijne.
W latach 1957-1958 przeprowadzony został generalny remont budynku po zniszczeniach wojennych. Świątynię przekazano księżom pallotynom. Budowla stanowi element Europejskiego Szlaku Gotyku Ceglanego.