Kościół św. Piotra i św. Pawła to ceglana świątynia w stylu gotyckim, reprezentująca typ kościoła salowego. Na zewnątrz budowli widać konsole przedstawiające głowy średniowiecznych mieszkańców miasta. Znajdują się na murach kościoła i zakrystii, pełniąc rolę podstawy do rzeźb, które nie zachowały się do współczesnych czasów. Warto również zwrócić uwagę na drewniany plafon o wymiarach 27x3 m z początku XVIII w, autorstwa Philippa Ernsta Eichnera.
Pierwotnie w miejscu tym stał drewniany kościół, wybudowany w 1124 roku. Była to prawdopodobnie pierwsza budowla sakralna na terenie Szczecina. Został spalony podczas najazdu Duńczyków. Budowę nowego rozpoczęto dopiero trzydzieści lat później. Tym razem był to już budynek ceglany. Na przestrzeni wieków, kościół kilkukrotnie ulegał zniszczeniu i przebudowom. W 1602 roku dobudowano m.in. istniejącą do dzisiaj sygnaturkę. Obecnie świątynia należy do parafii Kościoła Polskokatolickiego.