Ogród Botaniczny jest najstarszym tego typu obiektem w Polsce. W szklarniach mieszczą się rośliny tropikalne. Zewnętrzne kolekcje to: Rośliny biblijne, chronione, ozdobne, wodne, lecznicze i inne użytkowe, Alpinarium, Arboretum, Systematyka roślin i Biologia roślin. Znajduje się tu także stacja meteorologiczna i dawne obserwatorium astronomiczne.
Ogród Botaniczny powstał w 1783 roku w miejscu dawnego ogrodu rodziny Czartoryskich, od 1752 roku będącego własnością jezuitów. Początkowo obszar ogrodu zajmował ok. 2,4 ha i został zaprojektowany jako park barokowy typu francuskiego. Współcześnie zajmuje powierzchnię 9,6 ha.
W latach 1788–1792 wybudowano gmach Obserwatorium Astronomicznego, zwany Collegium Śniadeckiego. Mieści się w nim współcześnie Instytut Botaniki Uniwersytetu Jagiellońskiego. Kolekcje roślin tropikalnych znajdują się w trzech szklarniach: Victoria, Jubileuszowa i Holenderka.