Zbiory muzeum kościelnego to dzieła sztuki sakralnej, sztuki dawnej oraz polskiej sztuki współczesnej. Znajduje się w nim ponad 20 tysięcy eksponatów takich, jak pamiątki po prymasie Stefanie Wyszyńskim i przedmioty związane z pobytami Jana Pawła II w Warszawie. Ekspozycja stała prezentuje między innymi zbiór drzeworytów Albrechta Dürera, a także dzieła Jana Matejki, Stanisława Wyspiańskiego i Jacka Malczewskiego.
Muzeum zostało założone w 1938 r. Wtedy jego siedziba mieściła się przy ul. Kanonia. Najcenniejsze eksponaty zostały wywiezione przez Niemców po Powstaniu Warszawskim, a budynek został doszczętnie spalony. Z inicjatywy Stefana Wyszyńskiego placówka została reaktywowana, a w 1980 r. otrzymała nową siedzibę w poklasztornym budynku przy kościele Trójcy Przenajświętszej. W stanie wojennym działały tu grupy artystyczne.
W 2016 r. placówka rozpoczęła działalność w obecnej siedzibie.
Atrakcje wewnątrz

