Muzeum dokumentuje i pokazuje męczeństwo mieszkańców regionu w okresie II wojny światowej. Jego siedzibą jest fort VII Colomb Twierdzy Poznań. W czasie II wojny światowej na jego terenie działał obóz koncentracyjny. W muzeum znajdują się dokumenty obozowe, listy, pamiątki po więźniach i przedmioty codziennego użytku.
Fort VII został wybudowany w końcu XIX wieku. Był jednym z 18 fortów wchodzących w skład Twierdzy Poznań. Najcięższe walki toczyły się tu w czasie Powstania Wielkopolskiego. W czasie II wojny światowej na jego terenie Niemcy utworzyli obóz koncentracyjny KL Posen, w którym po raz pierwszy w historii użyto gazu do mordowania ludności cywilnej. Obecnie trwają badania nad ustaleniem ilości ofiar, które zginęły w Forcie VII.
Muzeum Martyrologii Wielkopolan zostało powołane w latach sześćdziesiątych XX wieku. Na terenie Fortu VII pokazywane są dokumenty i zdjęcia więźniów, wykonane przez nich przedmioty, między innymi różańce i figurki z chleba, korespondencja oraz przedmioty używane na terenie KL Posen.