Większość eksponatów została zaprezentowana w zabytkowej izbie dyspensacyjnej pochodzącej z przełomu dziewiętnastego i dwudziestego wieku. Na wystawach można obejrzeć przedmioty będące niegdyś nieodłączną częścią wyposażenia każdej apteki. Znaczna część muzealiów pochodzi z XIX i XX wieku, jednak najstarsze obiekty datowane są na koniec siedemnastego wieku.
Na ekspozycje składają się naczynia apteczne wytworzone z cyny, białego i barwionego szkła, z drewna, porcelany, czy kamionki. Obok nich poustawiano majolikowe puszki, służące jako ozdoba wnętrza. Obejrzeć tu również można sprzęt laboratoryjny, destylarki, prasy, tabletkarki i kolekcje moździerzy. Wystawę wzbogacają stare opakowania apteczne, księgozbiory i starodruki.
Większość muzealiów stanowiących ekspozycje muzealne to darowizny oraz depozyty otrzymane od wielkopolskich farmaceutów, a także od Muzeum Farmacji Uniwersytetu Jagiellońskiego. Niewielka część z eksponatów została zakupiona.