Kościół św. Apostołów Piotra i Pawła był pierwszą gotycką budowlą w Krakowie, ufundowaną dla jezuitów przez Zygmunta III Wazę. W bogato zdobionym wnętrzu kościoła zwiedzający mogą zobaczyć wiele pięknych przykładów sztuki barokowej: stiukowe dekoracje, liczne posągi i obrazy, a także późnobarokowy ołtarz. Kościół posiada także krypty.
Do ciekawostek należy znajdujące się w kościele wahadło Foucaulta o długości 46,5 metra i tym samym najdłuższe takie wahadło w Polsce. Urządzenie to pozwala zaobserwować ruch obrotowy Ziemi.
Plany kościoła przygotowywało i modyfikowało kilku architektów, ale swój ostateczny kształt budowla zawdzięcza Giovanniemu Trevano, który zaprojektował fasadę, kopułę oraz wystrój wnętrza. Na początku XIX wieku przez kilka lat budynek kościoła służył jako prawosławna cerkiew.