Kolekcja muzeum to bogaty zbiór eksponatów związanych z terenem ziemi kłodzkiej. Można tu obejrzeć trzy wystawy stałe: Z dziejów Kłodzka, Współczesne kłodzkie szkło artystyczne na tle tradycji szklarstwa na ziemi kłodzkiej i Oczy czasu. Prezentowana jest na nich tysiącletnia historia Kłodzka, historia kłodzkiego przemysłu na przestrzeni wieków oraz śląskie zegary mechaniczne z XIX i XX wieku.
Na wystawie znajduje się m.in. ponad 200 unikatowych dzieł miejscowych artystów oraz kilkaset zegarów, w tym wyroby dwóch największych fabryk dolnośląskich w XIX i XX wieku. Muzeum organizuje również wystawy czasowe. Biblioteka naukowa liczy ponad 9,5 tys. woluminów.
Muzeum Ziemi Kłodzkiej zostało otwarte w 1963 roku. W 1971 roku zmieniło swoją siedzibę na budynek dawnego konwiktu jezuickiego. Remont i adaptacja na potrzeby muzeum zabytkowego gmachu trwała 10 lat, ale dzięki temu zachowano wszystkie elementy tego XVII wiecznego zabytkowego budynku.