W zbiorach muzeum znajdują się eksponaty dokumentujące historię Gdańska od średniowiecza do współczesności. Odwiedzający mogą zobaczyć kolekcje malarstwa, grafiki, rzemiosła artystycznego przedstawiające architekturę i urbanistykę miasta, życie codzienne i obyczaje mieszkańców oraz wydarzenia i postacie historyczne. Muzeum organizuje również lekcje muzealne, cykliczne warsztaty dla najmłodszych oraz pokazy historyczne.
Jednym z eksponatów znajdującym się w muzeum jest salamandra. Jest to żywiołak, czyli postać związana z siłami natury. Legenda głosi, że posiadanie znaku salamandry w budynku chroni mury przed pożarem, stąd też umieszczenie podobizny tego magicznego stworzenia u szczytu kominka w Sali Zimowej Ratusza. Niestety, moc salamandry nie uchroniła Ratusza przed ogniem w 1945 roku, kiedy to w wyniku działań wojennych zniszczone zostało niemal całe miasto.
Muzeum znajduje się w gotycko-renesansowym budynku ratusza Głównego Miasta.