Muzeum Historyczne w Białymstoku w głównej mierze prezentuje wystawy dotyczące historii miasta oraz regionu. Jako jedyna placówka w Polsce posiada muzealia związane z osadnictwem tatarskim na pograniczu polsko-litewsko-białoruskim.
W muzeum mieści się ponad 35 tys. eksponatów. W dziale realia można podziwiać przedmioty codziennego użytku: meble, naczynia, biżuterię, papierośnice, a także dzieła sztuki. Dział archiwalia liczy sobie ponad 7000 obiektów. Są to niezwykle cenne i rzadkie dokumenty dotyczące oświaty, przemysłu, kultury, a także archiwa rodzinne, zbiory map i planów miasta z XIX i XX wieku oraz stare wydania gazet białostockich. Prezentowane są tu również eksponaty związane z białostockim przemysłem XIX i XX wieku. Ciekawą atrakcją jest kolekcja muzealiów, prezentujących dzieje ludności tatarskiej wyznającej islam.
Kolejne zbiory, mieszczące się w muzeum prezentują ikonografię. Znajdują się tu tysiące fotografii, negatywów, pocztówek i albumów. W Gabinecie Numizmatycznym umieszczono stare polskie i zagraniczne monety, banknoty, papiery wartościowe i żetony. Najstarsze okazy pochodzą z Grecji i mają około 2300 lat. Jednym z najcenniejszych eksponatów są rzadkie półgrosze litewskie Zygmunta II Augusta wybite w mennicy tykocińskiej.