W zbiorach Muzeum Mineralogicznego Uniwersytetu w Hamburgu znajdują się minerały, rudy, kamienie szlachetne, skały i meteoryty. Kolekcja ta jest jedną z największych tego typu w Niemczech – liczy ponad 90 000 obiektów, w tym ponad 900 meteorytów.
W kolekcji muzeum znajdują się tak unikalne eksponaty jak 424-kilogramowy Gibeon - meteoryt z Namibii czy największy na świecie kryształ antymonitu z Japonii. Większa część ekspozycji poświęcona jest jednak minerałom. Inne tematy wystawy obejmują meteoryty, biżuterię i kamienie szlachetne, a także skały. Z uwagi na ścisłą symbiozę z Uniwersytetem i profil placówki, eksponaty prezentowane są jako dzieła sztuki natury.
W konkretnych dniach i godzinach otwarcia muzeum odwiedzający mogą przynieść własne znaleziska do zbadania przez ekspertów (bezpłatnie). Specjaliści oferują także odpłatną usługę badania kamieni szlachetnych i pereł pod kątem autentyczności.