Auxerre jest historycznym miastem, w którym zachowało się wiele średniowiecznych zabytków. W jego okolicach produkuje się znane burgundzkie wina w tym słynne Chablis.
Miasto zostało założone przez Rzymian na szlaku handlowym. Po upadku Cesarstwa bardzo szybko stało się stolicą biskupstwa, a następnie rozwinął się tu port rzeczny, z którego transportowano m.in. burgundzkie wina. Dziś o dawnej świetności miasta przypominają jego liczne zabytki.
Najważniejszym zabytkiem i główną atrakcją Auxerre jest gotycka katedra św. Szczepana. Stoi na miejscu kościoła wzniesionego już w VI w., którego elementy odkryto pod budowlą. W krypcie oglądać można romańskie freski, skarbiec katedralny kryje m.in. relikwie świętych.
Oprócz katedry, drugim ważnym kościołem Auxerre jest kościół klasztorny Saint-Germain. Święty German był na przełomie IV i V w. tutejszym biskupem i został pochowany na terenie założonego przez siebie klasztoru. W VIII w. sprowadzono do opieki nad nim benedyktynów, którzy założyli znaną w całej Francji szkołę.
W obrębie starego miasta w Auxerre zachowało się także sporo domów o konstrukcji szachulcowej, gotycka wieża zegarowa oraz kilka innych kościołów.