La sinagoga ubicada en el edificio Yeshiva Chachmej es también un lugar activo de oración para la comunidad judía y la Cámara Conmemorativa de los Judíos de Lublin. El interior de la casa de oración, de dos plantas, fue recreado fielmente entre 2003 y 2007, y en las colecciones se pueden ver muchos monumentos religiosos valiosos.
La sala de oración está ubicada en una de las salas de la planta baja. En varios lugares vecinos, puedes ver numerosas exhibiciones que documentan la historia de la ieshivá y conmemoran la figura del rabino Majer Szapira. Durante muchos años, la sinagoga fue un lugar de reunión para los judíos de Lublin, funcionó como una casa privada de oración desde 1889.
Albergó a grandes figuras, incluido el rabino Majer Szapira, fundador de la Escuela de Sabios de Lublin, así como a Mosze Ajzenberg y Dawid Muszkatblit, quienes dieron famosas conferencias talmúdicas.
La sinagoga tuvo mucha suerte durante la Segunda Guerra Mundial, porque su ubicación fuera del gueto judío la salvó de la destrucción. El edificio fue utilizado por los alemanes como hospital. En 1945, el edificio fue administrado por la Academia de Medicina. El edificio fue devuelto a la Comunidad Religiosa Judía en 2003 y luego se tomó la decisión de reconstruir el interior.