St. John ist eine Perle der Barockkunst, ein Tempel der Knights Hospitaller (Hospitallers, Knights of Malta), der 1573-1578 nach dem Entwurf von Girolamo Cassar errichtet wurde. Es gibt viele Relikte in der Kathedrale, einschließlich der rechten Hand von St. Johannes der Täufer. Die wertvollsten Gemälde sind zwei Gemälde von Michelangelo Merisi da Caravaggio - "Die Enthauptung des hl. Johannes der Täufer "und" St. Hieronymus der Schriftsteller.
Die Kathedrale verfügt über die weltweit größte Sammlung von Wandteppichen - 29 Wandteppiche mit Szenen aus dem Leben Christi. Sie sind ein Geschenk des Großmeisters Ramon Perellos y Roccaful, der 1697 gewählt wurde. Nach dem Kodex des Knights Hospitaller war jeder neue Großmeister verpflichtet, der Kirche ein großzügiges Geschenk zu machen. Der Boden der Kathedrale ist mit Grabsteinen der hier begrabenen Ritter bedeckt.
Jede der acht im Tempel befindlichen Kapellen ist einer der "Sprachen" gewidmet, dh einer der nationalen und territorialen Formationen der Knights Hospitaller, die aus der Provence, der Auvergne, Frankreich, England, Italien, Deutschland, Aragonien und Kastilien stammten.