San Giovanni in Conca to krypta dawnej bazyliki w centrum Piazza Missori w Mediolanie. Jest to jedyny w mieści zachowany do czasów współczesnych przykład romańskiej krypty. Nad kryptą znajdują się pozostałości dawnej apsydy z arkadami. Znaleziska archeologiczne pozwalają zilustrować historię dawnego kościoła w tym miejscu. Pozostałości zostały umieszczone w Zamku Sforzów. Najważniejszymi eksponatami są dwie rzeźby z XI wieku przedstawiające zwiastowanie, pomniki grobowe oraz romańskie kapitele i freski datowane na XIV wiek.
Bazylika San Giovanni in Conca pochodzi z IV wieku i znajdowała się w dzielnicy mieszkalnej starożytnego miasta. Pozostałości mozaikowej nawierzchni tego oryginalnego budynku znajdują się obecnie w Muzeum Archeologicznym w Mediolanie. Kościół został ostatecznie zburzony w 1949 roku.