Muzeum Almerii mieści największą i najbardziej reprezentatywną kolekcję obiektów archeologicznych w całym regionie. Stała wystawa znajduje się na pierwszym i drugim piętrze. Jest podzielona na trzy zasadnicze części: społeczeństwo łowiecko-zbierackie, historia Los Millares, chalkolitycznej osady obronnej z III tysiąclecia p.n.e., położonej w regionie Almeríi oraz kultura El Argar z epoki brązu.
Można tu obejrzeć m.in. kolekcję ceramiki, broni wykonanej z brązu, przedmiotów ze srebra i złota oraz narzędzi. Na trzecim piętrze mieszczą się ekspozycje długoterminowe, poświęcone najczęściej wystawom eksponatów rzymskich i andaluzyjskich. Te ostatnie są reprezentowane przez obszerną kolekcję muzułmańskich nagrobków, dawniej wytwarzanych w Almeríi
Ponadto w muzeum znajduje się przestrzeń wystawiennicza, gdzie są organizowane tymczasowe wystawy dzieł sztuki współczesnej i fotografii. Mieści się tu także powszechnie dostępna biblioteka.