Kościół św. Franciszka w Zagrzebiu został wybudowany w XIII wieku jako część kompleksu klasztornego należącego do zakonu franciszkanów. Jego wnętrze kryje do dziś wiele cennych zabytków sztuki sakralnej, można tu zobaczyć na przykład neogotycki ołtarz z obrazem przedstawiającym postać św. Franciszka - dzieło Celestina Medovića oraz witraże Ivo Dulcića.
Pierwotnie budowla reprezentowała styl gotycki, jednak w czasie wielkiego trzęsienia ziemi w 1880 roku została zniszczona. W wyniku prac renowacyjnych kościół zyskał nowy kształt, jego fasada nosi dziś cechy stylu neogotyckiego.
Zgodnie z miejscową legendą św. Franciszek mieszkał przez jakiś czas w Zagrzebiu, zatrzymał się w domu bardzo bogatej wdowy, która przekazała swoją ziemię w celu wybudowania na niej klasztoru oraz kościoła poświęconego świętemu.