Muzej grada Šibenika, czyli Muzeum Miejskie Šibenika znajduje się w starej części miasta w Pałacu Rektorów – dawnej siedzibie władz miejskich. Na wystawach stałych prezentowane są eksponaty dokumentujące historię miasta od VI tysiąclecia p.n.e. do końca XVIII w., czyli do upadku Republiki Weneckiej. Muzeum powołano do istnienia w 1925 r., z okazji 1000-lecia Królestwa Chorwacji.
Osobna ekspozycja poświęcona jest władcom Chorwacji z czasów Królestwa Chorwacko-Węgierskiego (XI-XV w.). Można tu zobaczyć rzadkie przykłady sztuki romańskiej z XIII w. oraz XIV-wieczny poliptyk słynnego weneckiego malarza Paola Veneziana. Wystawa jest wyposażona w liczne multimedia, dzięki którym zwiedzający mają okazję wysłuchać m. in. najstarszego znanego wiersza-modlitwy, który powstał w Šibeniku.
Ciekawostką jest multimedialna rekonstrukcja zniszczenia Šibenika z 1378 r. w czasie wojny Republiki Weneckiej przeciwko Republice Genui. Wenecki admirał Vettor Pisani zdobył i spalił miasto, które od tamtej pory pozostawało pod kontrolą Wenecji aż do 1797 r.