Arheološki muzej, czyli Muzeum Archeologiczne dysponuje ogromnym zbiorem artefaktów, podzielonych na osobne kolekcje – prehistoryczną, grecką, romańską, wczesnochrześcijańską, starochorwacką oraz zbiory epigramów, monet i przedmiotów wydobytych z dna morskiego. Szczególnie obszerna jest licząca 70 tys. zabytków kolekcja numizmatyczna, w której znajdują się m. in. złote, srebrne i brązowe monety z okresu greckiego.
Jednym z najcenniejszych eksponatów jest kompletnie zachowany, wykonany z brązu hełm z IV w. p.n.e. Z tego samego okresu pochodzą też brązowe zapinki, platerowane srebrem. Najstarszymi zabytkami są gliniane naczynia rytualne, datowane na 4 tysiąclecie p.n.e. oraz pochodzący z okresu 1100-1000 r. p.n.e. brązowy miecz.
Swoje początki muzeum wywodzi z prywatnej kolekcji epigramów, którą w XVI w. stworzył Dominik Papalic, zamożny szlachcic i humanista ze Splitu. Epigramy odnalazł w czasie wędrówek po ruinach rzymskiego miasta Salona (dzisiejsze Solin). Część zbioru Papalicia eksponowana jest obecnie w atrium Muzeum Archeologicznego.