S t. John es una perla del arte barroco, un templo de los Caballeros Hospitalarios (Hospitalarios, Caballeros de Malta) construido en 1573-1578 según el diseño de Girolamo Cassar. Hay muchas reliquias en la catedral, incluida la mano derecha de St. Juan el Bautista. Las obras de pintura más valiosas son dos pinturas de Michelangelo Merisi da Caravaggio - "La decapitación de St. Juan el Bautista "y" St. Jerónimo el escritor.
La catedral tiene la colección de tapices más grande del mundo: 29 tapices que representan escenas de la vida de Cristo. Son un regalo del Gran Maestre Ramón Perellos y Roccaful, elegido en 1697. Según el Código de los Caballeros Hospitalarios, cada nuevo Gran Maestre tenía la obligación de entregar a la iglesia un generoso regalo. El suelo de la catedral está cubierto de lápidas de los caballeros enterrados aquí.
Cada una de las ocho capillas del templo está dedicada a una de las "lenguas", es decir, una de las formaciones nacional-territoriales de los Caballeros Hospitalarios, que procedían de Provenza, Auvernia, Francia, Inglaterra, Italia, Alemania, Aragón y Castilla.
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