Der Botanische Garten ist der älteste seiner Art in Polen. Tropische Pflanzen sind in Gewächshäusern untergebracht. Die externen Sammlungen sind: biblische Pflanzen, geschützte Pflanzen, Zierpflanzen, Wasserpflanzen, Heilpflanzen und andere Nutzpflanzen, Alpinarium, Arboretum, Pflanzensystematik und Pflanzenbiologie. Es gibt auch eine Wetterstation und ein ehemaliges astronomisches Observatorium.
Der Botanische Garten wurde 1783 an der Stelle des ehemaligen Familiengartens Czartoryski angelegt, der ab 1752 den Jesuiten gehörte. Die Gartenfläche betrug zunächst ca. 2,4 ha und wurde als französischer Barockpark angelegt. Heute umfasst es eine Fläche von 9,6 ha.
In den Jahren 1788–1792 wurde das als Śniadecki Collegium bekannte Gebäude des Astronomischen Observatoriums errichtet. Es beherbergt heute das Institut für Botanik der Jagiellonen-Universität. Sammlungen tropischer Pflanzen sind in drei Gewächshäusern erhältlich: Victoria, Jubilee und Dutch.