Die Muse von Šibenik oder das Stadtmuseum von Šibenik befindet sich in der Altstadt im Rektorenpalast - dem ehemaligen Sitz der Stadtverwaltung. Dauerausstellungen zeigen die Geschichte der Stadt vom 6. Jahrtausend v. Chr. Bis zum Ende des 18. Jahrhunderts, d. H. Bis zum Fall der Venezianischen Republik. Das Museum wurde 1925 anlässlich des 1000. Jahrestages des Königreichs Kroatien gegründet.
Eine separate Ausstellung ist kroatischen Herrschern aus der Zeit des kroatisch-ungarischen Königreichs (11.-15. Jahrhundert) gewidmet. Hier sehen Sie seltene Beispiele romanischer Kunst aus dem 13. Jahrhundert und das Polyptychon des berühmten venezianischen Malers Paolo Venezian aus dem 14. Jahrhundert. Die Ausstellung ist mit zahlreichen Multimedia-Inhalten ausgestattet, dank derer die Besucher unter anderem die Möglichkeit haben, zuzuhören das älteste bekannte Versgebet, das in Šibenik geschrieben wurde.
Eine interessante Tatsache ist die multimediale Rekonstruktion der Zerstörung von Šibenik ab 1378 während des Krieges der Venezianischen Republik gegen die Republik Genua. Der venezianische Admiral Vettor Pisani eroberte und verbrannte die Stadt, die von da an bis 1797 unter der Kontrolle Venedigs blieb.