Миссионерско-орнитологический музей в Кодене - это сакрально-природный музей, расположенный в здании у монастырских ворот. Внутри два выставочных зала. В первом представлены сувениры, привезенные монахами с миссий, и яйца многих видов птиц. Во втором зале демонстрировались предметы и произведения сакрального искусства. В подвале святилища находятся склепы с гробами людей, связанных с городом, и выставка их восковых фигур.
В первом зале в основном сувениры, привезенные миссионерами из разных стран мира. В их состав входят элементы костюмов, музыкальные инструменты и предметы быта. Дополнила выставку выставка птичьих яиц. Во втором зале, среди прочего, были представлены старинные ризы, чаши, книги, изображения Коденской Богоматери, а также старые монеты и банкноты.