Музей Вигнакура - это великолепное сооружение с тремя уровнями, открытыми для посетителей. Самый низкий, подземный, - это прежде всего грот Св. Павла и лабиринт коридоров и захоронений пунических, римских и христианских времен. На первом этаже - административные помещения и сад. В выставочных залах на первом этаже, среди прочего, впечатляющая коллекция картин (Маттиа Прети, Антуан Фавре, Франческо Захра) и предметов культа, в том числе реликварий св. Матфей Евангелист и копия Туринской плащаницы.
На выставках в музее Вигнакура также представлена богатая коллекция серебряных изделий XVI-XIX веков, скульптуры из дерева, алебастра и бронзы, карты и монеты. Интересным фактом является переносной алтарь, используемый для богослужений рыцарей, служащих на галерах.
Грот, в котором находится церковь Св. Апостол Павел должен был жить в 60 году нашей эры во время своего придворного путешествия в Рим, он стал известным и стал местом паломничества еще в 17 веке благодаря усилиям Великого Магистра Алофа де Виньякура, в честь которого назван сегодняшний музей.