Кафедральный музей в Мдине считается одним из лучших церковных музеев Европы. Коллекция включает в себя множество ценных картин, гравюр Рембрандта, древние реликварии и подлинные средневековые рукописи, в том числе записи Святой инквизиции с начала 15 века. Соборный музей знаменит богатой коллекцией произведений Альбрехта Дюрера (1471-1528), который считается величайшим художником немецкого Возрождения.
Коллекция Дюрера состоит из обширной коллекции гравюр на дереве и медных пластин. Особо выделяются сериалы «Жизнь Богородицы» (серия сцен из жизни Девы Марии) и «Малые страсти» (образы страстей и смерти Христовых). Отдельного внимания заслуживает коллекция из нескольких скульптур апостолов из золота и серебра.
Резиденция Кафедрального музея - роскошный дворец в стиле барокко, построенный в 1733 году по приказу архиепископа Мдина Паоло Альферан де Буссан (1728-1757). Здесь располагалась духовная семинария - музей был основан в 1969 году.