Национальный музей естественной истории расположен во дворце 18 века, построенном Великим магистром рыцарей госпитальеров Антонио Маноэлем де Вильена. В музее представлены экспонаты из разных областей, в том числе посвященные Мальтийская геология и палеонтология, флора и фауна Средиземного моря. Гордость коллекции - самый крупный кальмар, когда-либо пойманный у берегов Мальты.
Музей принадлежал так называемой Лунная скала Доброй воли - обломок лунной скалы, принесенный космической миссией Аполлон 17. Президент США Ричард Никсон в 1973 году раздал каменные крошки всем странам мира, включая Мальту. Лунный камень стоимостью 5 миллионов долларов был украден неизвестными преступниками в 2004 году.
В музее можно увидеть богатые коллекции насекомых, раковин и птиц. На диорамах показаны типичные места обитания отдельных видов. В объекте также хранится коллекция из нескольких сотен горных пород и минералов, представленных в сыром и обработанном виде (украшения, украшения и хозяйственные предметы).