В музее Эль Греко представлена богатая коллекция испанских картин, в частности, работы Эль Греко. Кроме того, здесь представлена выставка мебели, керамики и предметов домашнего обихода 17 века. Наиболее ценными элементами коллекции являются портреты апостолов и картина «Вид Толедо с планом». Миссия музея - популяризация испанского искусства 17-го века и представление фигуры Эль Греко и его связи с городом.
Официально музей был открыт в 1911 году. Он расположен в двух зданиях, соединенных общим садом. Здание 16-го века первоначально принадлежало королевскому казначею Сэмюэлю Халеви. Эль Греко прожил в этом месте 27 лет своей жизни с небольшими перерывами. В 1907 году здание отреставрировали. В 20 веке к саду была пристроена дополнительная постройка.