S t. Juan de Nepomuk, también conocido como la "Iglesia sobre el agua", es uno de los símbolos de Zwierzyniec. El pequeño templo barroco tiene una ubicación pintoresca en la isla de Kościelny Pond. La fachada con frontón triangular se integra en los edificios de la antigua escuela. Cerca hay una fuente que le da encanto al edificio.
El estanque y la isla de Zwierzyniec fueron construidos por orden de Marysieńka, esposa de Jan Sobiepan Zamoyski, y más tarde esposa del rey Jan III Sobieski. La iglesia fue erigida aquí en los años 1741-1747. Fue construida por el ordenado Tomasz Zamoyski como ofrenda votiva por el nacimiento de su hijo, Klemens. Más tarde, se agregó una escuela al templo.
Es un pequeño edificio barroco. La parte frontal da al puente que conecta la isla con el continente. Está coronado por un frontón triangular y la fachada está dividida por ventanas ciegas y cornisas. El interior está cubierto con una policromía barroca de Łukasz Smuglewicz.
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