La exposición del museo es una colección de instrumentos científicos, esculturas, pinturas y gráficos, productos de artes y artesanías fotográficas, así como muebles de los siglos XV al XX presentados en interiores históricos. Destaca la colección de cetros universitarios de antiguos rectores y de la facultad de teología. Los cetros hechos de plata e incrustados con piedras preciosas son obras de arte de los orfebres de Wroclaw.
La colección del museo también incluye los interiores originales del Aula Leopoldina, con un hermoso interior barroco, con una gran cantidad de frescos murales, ornamentos de estuco y esculturas. También es igualmente rico el Oratorium Marianum, construido como capilla en el siglo XVIII, en el que los grandes maestros del arte y la arquitectura participaron en la ejecución y decoración. El museo se complementa con la Torre Matemática, que ahora es un espacio de exposición y anteriormente se utilizaba como observatorio astronómico. Hoy en día, hay una plataforma de observación con una vista panorámica de Wrocław.
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