S t. Jacek es parte del complejo del monasterio de los Padres Dominicos. Aunque ha sido dañado muchas veces durante los siglos de su existencia, elementos del antiguo equipo han sobrevivido en él, incluyendo Capilla de Kotowski de 1691-1694 y lápida de Katarzyna Ossolińska née Kosińska de 1607.
El edificio fue construido en el siglo XVII por los burgueses de Varsovia. En 1603, el obispo de Poznań emitió un permiso de construcción para una iglesia y un monasterio. S t. Jacek, que es el patrón del templo, fue dos veces prior de la casa religiosa dominica.
En el siglo XVII los habitantes del monasterio sufrieron una epidemia de cólera. Durante el Diluvio sueco, se llevaron a cabo negociaciones entre los enviados de Karol Gustaw y el Ayuntamiento de Varsovia sobre la rendición de la ciudad.
Durante el Levantamiento de Varsovia, se organizó un hospital insurgente en la iglesia. Más de 1.000 personas murieron en el subsuelo como resultado de los bombardeos y los bombardeos de artillería. La instalación fue reconstruida en 1947-59.
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