El Museo de la Región de Sejny recopila colecciones relacionadas con la arqueología, dominicanos, obispos de Sejny, el ejército polaco, numismática, escuelas de Sejny y el multiculturalismo de la región. Además, la instalación organiza lecciones de museo para niños y jóvenes, y se ocupa de la publicación y protección de monumentos.
Dentro del museo hay varias exposiciones presentadas en salas separadas. La sala de numismática muestra colecciones de billetes y monedas de varios países y épocas. En la sala dedicada a los obispos dominicos y sejny, veremos numerosos documentos religiosos, cartas oficiales, retratos de papas y obispos, así como artículos litúrgicos y obsequios de los feligreses.
Una de las salas está relacionada con las escuelas de Sejny, donde podemos ver libros de texto antiguos, diarios escolares y testimonios. En la sala militar se exhiben sables, rifles, bayonetas y álbumes, crónicas, fotografías conmemorativas y documentos secretos. La última sala presenta exposiciones relacionadas con la multiculturalidad de la región, como las Biblias alemanas y ortodoxas y los libros de oraciones polacos, publicaciones de una imprenta lituana de principios del siglo XX o artículos de la "cocina lituana".