El acuario de Gdynia es un zoológico estrechamente relacionado con la flora y fauna marina. Hay hasta 68 acuarios en la instalación. Los animales que se pueden ver en ellos provienen de los rincones más lejanos del mundo, incl. de África, América del Norte o Europa del Norte. La exposición se complementa con información en paneles de información y paneles de información.
En acuarios de agua dulce se puede ver, entre otros. Anacondas verdes, anguilas eléctricas, axolotls mexicanos que se asemejan a dragones, los cocodrilos más pequeños del mundo, es decir, cocodrilos de cabeza corta y otros anfibios, reptiles y peces.
Los acuarios de agua salada, a su vez, están ocupados por organismos que viven en el arrecife de coral, entre ellos peces de colores, caballitos de mar, corales duros y blandos. Los otros acuarios llenos de agua salada contienen animales que viven de forma natural en las profundidades de los océanos o en zonas costeras; estos son, por ejemplo, tiburones de mármol, estrellas de mar, nautilus y cangrejos.