La rama principal del Museo Histórico está ocupada por el impresionante Palacio Krzysztofory en la plaza principal. Hay una exposición "De la historia y la cultura de Cracovia". Muestra la historia de los gremios artesanales de Cracovia, el autogobierno de la ciudad y las tradiciones y costumbres únicas de Cracovia.
El museo ha estado funcionando en el Palacio Krzysztofory desde 1964. Anteriormente, se llamaba Archivo de Registros Históricos de la Ciudad de Cracovia. Actualmente, se ocupa de la totalidad de los cambios y la historia de las instituciones municipales, así como de las tradiciones y la cultura específicas de Cracovia.
La exposición en el Palacio Krzysztofory está dedicada a la historia y la cultura de Cracovia. Aquí se recogen armas, obras de arte, fotografías y documentos relacionados con la historia de la ciudad. La imagen se completa con reliquias familiares y objetos cotidianos de las casas de Cracovia. Tampoco se olvidaron las tradiciones locales, como los belenes de Cracovia, Lajkonik o la historia de la Hermandad Fowler.
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