La Iglesia de la Transfiguración de Cracovia y el monasterio escolapio forman un conjunto sagrado del siglo XVIII diseñado en estilo barroco tardío. Los autores del diseño de la iglesia fueron: el arquitecto polaco Kacper Bażanka y el arquitecto y escultor italiano Francesco Placidi (diseño de la fachada).
Muchos elementos arquitectónicos se refieren al templo de la orden jesuita Il Gesù en Roma. En el interior del edificio se pueden admirar las policromías de los pintores moravos: Franciszek Eckstein y Józef Piltz. Los adornos de la pintura se realizaron con una técnica de fresco húmedo, similar a las policromías romanas de Andrea Pozzo.
El corazón del sacerdote Stanisław Konarski, escolapio, reformador de la educación y fundador del Collegium Nobilium, se colocó en la iglesia. Fue construida en el lado derecho del altar. Su busto se colocó a la entrada del templo.