San Giovanni in Conca es la cripta de una antigua basílica en el centro de Piazza Missori en Milán. Es el único ejemplo de cripta románica que se ha conservado hasta nuestros días. Sobre la cripta se encuentran los restos del antiguo ábside con soportales. Los hallazgos arqueológicos ilustran la historia de la antigua iglesia en este lugar. Los restos se colocaron en el Castillo Sforza. Las exhibiciones más importantes son dos esculturas del siglo XI que representan la Anunciación, monumentos funerarios y capiteles y frescos románicos que datan del siglo XIV.
La Basílica de San Giovanni in Conca data del siglo IV y estaba ubicada en una zona residencial de la ciudad antigua. Los restos del pavimento de mosaico de este edificio original se encuentran ahora en el Museo Arqueológico de Milán. La iglesia fue finalmente demolida en 1949.
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